Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR2AP24928 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR2AP24928 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR2AP24928 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR2AP24928 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR2AP24928 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms