Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND1P24385 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND1P24385 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND1P24385 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND1P24385 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND1P24385 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND1P24385 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND1P24385 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND1P24385 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND1P24385 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND1P24385 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND1P24385 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND1P24385 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND1P24385 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND1P24385 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND1P24385 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND1P24385 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND1P24385 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND1P24385 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND1P24385 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND1P24385 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCND1P24385 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND1P24385 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND1P24385 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND1P24385 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND1P24385 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND1P24385 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND1P24385 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND1P24385 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND1P24385 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCND1P24385 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND1P24385 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND1P24385 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND1P24385 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND1P24385 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND1P24385 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCND1P24385 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND1P24385 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND1P24385 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND1P24385 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCND1P24385 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCND1P24385 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCND1P24385 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCND1P24385 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND1P24385 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCND1P24385 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCND1P24385 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND1P24385 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND1P24385 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCND1P24385 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND1P24385 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND1P24385 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND1P24385 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCND1P24385 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND1P24385 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND1P24385 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCND1P24385 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND1P24385 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND1P24385 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND1P24385 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND1P24385 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND1P24385 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND1P24385 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND1P24385 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND1P24385 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND1P24385 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND1P24385 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND1P24385 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCND1P24385 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms