Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMA2P24043 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA2P24043 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA2P24043 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA2P24043 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms