Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGS1P23219 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGS1P23219 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTGS1P23219 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGS1P23219 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGS1P23219 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGS1P23219 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTGS1P23219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTGS1P23219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGS1P23219 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 528.8 ms