Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCEA1P23193 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA1P23193 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms