Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK11BP21127 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK11BP21127 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms