Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5AP20339 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB5AP20339 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB5AP20339 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB5AP20339 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms