Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGCP20142 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGCP20142 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGCP20142 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGCP20142 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGCP20142 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGCP20142 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGCP20142 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGCP20142 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGCP20142 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGCP20142 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGCP20142 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGCP20142 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGCP20142 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGCP20142 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGCP20142 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGCP20142 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGCP20142 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGCP20142 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGCP20142 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGCP20142 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGCP20142 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGCP20142 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGCP20142 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGCP20142 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGCP20142 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGCP20142 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGCP20142 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGCP20142 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGCP20142 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGCP20142 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGCP20142 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGCP20142 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGCP20142 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGCP20142 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGCP20142 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGCP20142 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGCP20142 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGCP20142 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGCP20142 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGCP20142 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGCP20142 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGCP20142 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGCP20142 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGCP20142 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGCP20142 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGCP20142 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGCP20142 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGCP20142 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGCP20142 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGCP20142 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGCP20142 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGCP20142 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGCP20142 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGCP20142 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGCP20142 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGCP20142 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGCP20142 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGCP20142 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGCP20142 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGCP20142 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGCP20142 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGCP20142 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGCP20142 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGCP20142 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGCP20142 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGCP20142 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGCP20142 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGCP20142 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGCP20142 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGCP20142 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGCP20142 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGCP20142 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGCP20142 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGCP20142 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGCP20142 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms