Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT15P19012 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT15P19012 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT15P19012 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT15P19012 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT15P19012 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT15P19012 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT15P19012 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT15P19012 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT15P19012 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT15P19012 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT15P19012 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT15P19012 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT15P19012 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT15P19012 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT15P19012 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT15P19012 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT15P19012 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT15P19012 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT15P19012 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT15P19012 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT15P19012 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT15P19012 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT15P19012 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT15P19012 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT15P19012 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT15P19012 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT15P19012 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT15P19012 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT15P19012 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT15P19012 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT15P19012 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT15P19012 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT15P19012 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT15P19012 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT15P19012 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT15P19012 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT15P19012 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT15P19012 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT15P19012 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT15P19012 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT15P19012 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT15P19012 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT15P19012 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT15P19012 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT15P19012 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT15P19012 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT15P19012 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT15P19012 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT15P19012 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT15P19012 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT15P19012 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT15P19012 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT15P19012 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT15P19012 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT15P19012 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT15P19012 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT15P19012 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT15P19012 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT15P19012 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT15P19012 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT15P19012 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT15P19012 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT15P19012 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT15P19012 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT15P19012 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT15P19012 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT15P19012 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT15P19012 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT15P19012 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT15P19012 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT15P19012 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT15P19012 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT15P19012 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT15P19012 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms