Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBPP18428 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBPP18428 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LBPP18428 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBPP18428 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LBPP18428 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBPP18428 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBPP18428 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LBPP18428 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBPP18428 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBPP18428 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBPP18428 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBPP18428 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBPP18428 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LBPP18428 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LBPP18428 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LBPP18428 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LBPP18428 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LBPP18428 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LBPP18428 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LBPP18428 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LBPP18428 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LBPP18428 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LBPP18428 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LBPP18428 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LBPP18428 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LBPP18428 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LBPP18428 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LBPP18428 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LBPP18428 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LBPP18428 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LBPP18428 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LBPP18428 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LBPP18428 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LBPP18428 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LBPP18428 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LBPP18428 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LBPP18428 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LBPP18428 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LBPP18428 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LBPP18428 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LBPP18428 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBPP18428 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBPP18428 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBPP18428 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBPP18428 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBPP18428 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBPP18428 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBPP18428 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBPP18428 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBPP18428 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBPP18428 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBPP18428 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBPP18428 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LBPP18428 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBPP18428 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBPP18428 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBPP18428 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBPP18428 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBPP18428 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBPP18428 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms