Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB5P18084 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB5P18084 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB5P18084 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB5P18084 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms