Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCAP17252 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCAP17252 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms