Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF3P17036 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms