Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAV1P15498 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAV1P15498 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV1P15498 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV1P15498 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV1P15498 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV1P15498 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV1P15498 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV1P15498 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VAV1P15498 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV1P15498 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV1P15498 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAV1P15498 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV1P15498 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV1P15498 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV1P15498 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV1P15498 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV1P15498 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV1P15498 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAV1P15498 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV1P15498 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV1P15498 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV1P15498 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAV1P15498 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV1P15498 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV1P15498 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV1P15498 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV1P15498 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV1P15498 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV1P15498 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAV1P15498 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV1P15498 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VAV1P15498 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV1P15498 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV1P15498 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV1P15498 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV1P15498 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV1P15498 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV1P15498 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV1P15498 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV1P15498 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV1P15498 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV1P15498 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV1P15498 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV1P15498 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV1P15498 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV1P15498 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV1P15498 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV1P15498 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV1P15498 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV1P15498 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV1P15498 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV1P15498 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV1P15498 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV1P15498 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV1P15498 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV1P15498 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV1P15498 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV1P15498 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV1P15498 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV1P15498 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV1P15498 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV1P15498 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV1P15498 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV1P15498 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV1P15498 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV1P15498 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV1P15498 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV1P15498 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV1P15498 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV1P15498 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV1P15498 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV1P15498 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV1P15498 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV1P15498 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV1P15498 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV1P15498 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV1P15498 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV1P15498 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV1P15498 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV1P15498 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV1P15498 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV1P15498 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV1P15498 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms