Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2F2P13984 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2F2P13984 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms