Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH1P12830 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH1P12830 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH1P12830 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH1P12830 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH1P12830 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH1P12830 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH1P12830 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH1P12830 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH1P12830 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH1P12830 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH1P12830 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH1P12830 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH1P12830 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH1P12830 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH1P12830 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH1P12830 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH1P12830 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH1P12830 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH1P12830 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH1P12830 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH1P12830 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH1P12830 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH1P12830 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH1P12830 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH1P12830 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH1P12830 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH1P12830 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH1P12830 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH1P12830 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH1P12830 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH1P12830 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH1P12830 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH1P12830 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH1P12830 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH1P12830 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH1P12830 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH1P12830 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH1P12830 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH1P12830 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH1P12830 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH1P12830 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH1P12830 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH1P12830 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH1P12830 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH1P12830 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH1P12830 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH1P12830 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH1P12830 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH1P12830 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH1P12830 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH1P12830 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH1P12830 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH1P12830 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH1P12830 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH1P12830 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH1P12830 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH1P12830 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH1P12830 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH1P12830 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH1P12830 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH1P12830 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH1P12830 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH1P12830 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH1P12830 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH1P12830 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH1P12830 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH1P12830 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH1P12830 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH1P12830 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH1P12830 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH1P12830 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH1P12830 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH1P12830 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH1P12830 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH1P12830 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms