Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTHFD1P11586 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD1P11586 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD1P11586 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms