Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD8BP10966 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8BP10966 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8BP10966 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8BP10966 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8BP10966 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8BP10966 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8BP10966 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8BP10966 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8BP10966 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8BP10966 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8BP10966 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8BP10966 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8BP10966 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8BP10966 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8BP10966 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8BP10966 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8BP10966 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8BP10966 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8BP10966 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8BP10966 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8BP10966 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8BP10966 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8BP10966 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8BP10966 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8BP10966 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD8BP10966 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8BP10966 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8BP10966 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8BP10966 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8BP10966 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8BP10966 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8BP10966 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8BP10966 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8BP10966 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8BP10966 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8BP10966 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8BP10966 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8BP10966 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8BP10966 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8BP10966 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8BP10966 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8BP10966 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8BP10966 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8BP10966 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8BP10966 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8BP10966 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8BP10966 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8BP10966 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8BP10966 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8BP10966 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8BP10966 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8BP10966 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8BP10966 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8BP10966 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8BP10966 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8BP10966 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8BP10966 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8BP10966 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8BP10966 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8BP10966 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8BP10966 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8BP10966 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8BP10966 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8BP10966 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8BP10966 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8BP10966 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8BP10966 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8BP10966 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8BP10966 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8BP10966 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8BP10966 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8BP10966 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8BP10966 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8BP10966 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8BP10966 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8BP10966 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8BP10966 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8BP10966 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8BP10966 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8BP10966 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8BP10966 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8BP10966 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8BP10966 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD8BP10966 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8BP10966 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms