Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF1P10914 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF1P10914 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF1P10914 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF1P10914 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF1P10914 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF1P10914 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF1P10914 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF1P10914 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF1P10914 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRF1P10914 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF1P10914 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF1P10914 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF1P10914 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF1P10914 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF1P10914 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF1P10914 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF1P10914 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF1P10914 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF1P10914 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF1P10914 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF1P10914 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF1P10914 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF1P10914 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF1P10914 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF1P10914 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF1P10914 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF1P10914 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF1P10914 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF1P10914 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF1P10914 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF1P10914 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF1P10914 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF1P10914 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF1P10914 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF1P10914 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF1P10914 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF1P10914 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF1P10914 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF1P10914 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF1P10914 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF1P10914 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF1P10914 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF1P10914 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF1P10914 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF1P10914 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF1P10914 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF1P10914 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF1P10914 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF1P10914 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF1P10914 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF1P10914 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF1P10914 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF1P10914 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF1P10914 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF1P10914 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF1P10914 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF1P10914 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF1P10914 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF1P10914 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF1P10914 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF1P10914 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF1P10914 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF1P10914 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF1P10914 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF1P10914 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF1P10914 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF1P10914 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF1P10914 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF1P10914 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF1P10914 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF1P10914 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF1P10914 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF1P10914 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF1P10914 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF1P10914 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF1P10914 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF1P10914 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF1P10914 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF1P10914 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF1P10914 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF1P10914 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms