Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARAFP10398 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARAFP10398 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARAFP10398 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARAFP10398 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARAFP10398 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARAFP10398 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARAFP10398 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARAFP10398 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARAFP10398 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARAFP10398 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARAFP10398 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARAFP10398 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARAFP10398 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARAFP10398 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARAFP10398 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARAFP10398 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARAFP10398 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARAFP10398 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARAFP10398 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARAFP10398 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARAFP10398 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARAFP10398 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARAFP10398 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARAFP10398 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARAFP10398 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARAFP10398 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARAFP10398 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARAFP10398 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARAFP10398 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARAFP10398 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARAFP10398 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARAFP10398 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARAFP10398 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARAFP10398 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARAFP10398 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARAFP10398 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARAFP10398 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARAFP10398 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARAFP10398 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARAFP10398 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARAFP10398 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARAFP10398 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARAFP10398 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARAFP10398 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARAFP10398 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARAFP10398 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARAFP10398 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARAFP10398 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARAFP10398 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARAFP10398 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARAFP10398 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARAFP10398 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARAFP10398 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARAFP10398 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARAFP10398 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARAFP10398 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARAFP10398 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARAFP10398 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.3 ms