Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL3P10147 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL3P10147 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL3P10147 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL3P10147 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL3P10147 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL3P10147 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL3P10147 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL3P10147 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL3P10147 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL3P10147 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL3P10147 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL3P10147 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL3P10147 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL3P10147 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL3P10147 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL3P10147 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL3P10147 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL3P10147 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL3P10147 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL3P10147 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL3P10147 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL3P10147 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL3P10147 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL3P10147 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL3P10147 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL3P10147 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL3P10147 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL3P10147 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL3P10147 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL3P10147 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL3P10147 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL3P10147 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL3P10147 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL3P10147 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL3P10147 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL3P10147 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL3P10147 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL3P10147 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL3P10147 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL3P10147 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL3P10147 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL3P10147 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL3P10147 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL3P10147 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL3P10147 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL3P10147 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL3P10147 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL3P10147 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL3P10147 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL3P10147 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL3P10147 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL3P10147 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL3P10147 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL3P10147 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL3P10147 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL3P10147 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL3P10147 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL3P10147 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL3P10147 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL3P10147 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL3P10147 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL3P10147 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL3P10147 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL3P10147 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL3P10147 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL3P10147 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL3P10147 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL3P10147 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL3P10147 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL3P10147 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL3P10147 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL3P10147 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL3P10147 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms