Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC192P0DO97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC192P0DO97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC192P0DO97 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC192P0DO97 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC192P0DO97 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms