Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN1MW3P0DN78 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPN1MW3P0DN78 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN1MW3P0DN78 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN1MW3P0DN78 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN1MW3P0DN78 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPN1MW3P0DN78 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms