Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATE4P0C8F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PATE4P0C8F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms