Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
POLA1P09884 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
POLA1P09884 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
POLA1P09884 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
POLA1P09884 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
POLA1P09884 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
POLA1P09884 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
POLA1P09884 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
POLA1P09884 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
POLA1P09884 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
POLA1P09884 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
POLA1P09884 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
POLA1P09884 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
POLA1P09884 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
POLA1P09884 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
POLA1P09884 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
POLA1P09884 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
POLA1P09884 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
POLA1P09884 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
POLA1P09884 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
POLA1P09884 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
POLA1P09884 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
POLA1P09884 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
POLA1P09884 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
POLA1P09884 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
POLA1P09884 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
POLA1P09884 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
POLA1P09884 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
POLA1P09884 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
POLA1P09884 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
POLA1P09884 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
POLA1P09884 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
POLA1P09884 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
POLA1P09884 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
POLA1P09884 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
POLA1P09884 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
POLA1P09884 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
POLA1P09884 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
POLA1P09884 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
POLA1P09884 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
POLA1P09884 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
POLA1P09884 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
POLA1P09884 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
POLA1P09884 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
POLA1P09884 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
POLA1P09884 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
POLA1P09884 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
POLA1P09884 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
POLA1P09884 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
POLA1P09884 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
POLA1P09884 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
POLA1P09884 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
POLA1P09884 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
POLA1P09884 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
POLA1P09884 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
POLA1P09884 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
POLA1P09884 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
POLA1P09884 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
POLA1P09884 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
POLA1P09884 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
POLA1P09884 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.79■■■■■ 4.28
POLA1P09884 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
POLA1P09884 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
POLA1P09884 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
POLA1P09884 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
POLA1P09884 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
POLA1P09884 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
POLA1P09884 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
POLA1P09884 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
POLA1P09884 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
POLA1P09884 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
POLA1P09884 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
POLA1P09884 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
POLA1P09884 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
POLA1P09884 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
POLA1P09884 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
POLA1P09884 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
POLA1P09884 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
POLA1P09884 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
POLA1P09884 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
POLA1P09884 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
POLA1P09884 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
POLA1P09884 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
POLA1P09884 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
POLA1P09884 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
POLA1P09884 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
POLA1P09884 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
POLA1P09884 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
POLA1P09884 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
POLA1P09884 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
POLA1P09884 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
POLA1P09884 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
POLA1P09884 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
POLA1P09884 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
POLA1P09884 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
POLA1P09884 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
POLA1P09884 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
POLA1P09884 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
POLA1P09884 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
POLA1P09884 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms