Protein–RNA interactions for Protein: P07996

THBS1, Thrombospondin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1P07996 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS1P07996 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS1P07996 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS1P07996 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS1P07996 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS1P07996 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS1P07996 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS1P07996 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS1P07996 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS1P07996 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS1P07996 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS1P07996 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS1P07996 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THBS1P07996 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS1P07996 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS1P07996 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS1P07996 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS1P07996 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS1P07996 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS1P07996 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS1P07996 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS1P07996 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS1P07996 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS1P07996 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS1P07996 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS1P07996 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS1P07996 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THBS1P07996 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THBS1P07996 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS1P07996 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS1P07996 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS1P07996 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS1P07996 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS1P07996 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS1P07996 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS1P07996 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS1P07996 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS1P07996 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS1P07996 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS1P07996 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS1P07996 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS1P07996 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS1P07996 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS1P07996 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS1P07996 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS1P07996 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS1P07996 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS1P07996 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS1P07996 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS1P07996 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS1P07996 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS1P07996 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS1P07996 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS1P07996 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS1P07996 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS1P07996 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS1P07996 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS1P07996 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS1P07996 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS1P07996 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS1P07996 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS1P07996 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THBS1P07996 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THBS1P07996 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
THBS1P07996 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS1P07996 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS1P07996 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS1P07996 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms