Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNP07948 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNP07948 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNP07948 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNP07948 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNP07948 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNP07948 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNP07948 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNP07948 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNP07948 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNP07948 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYNP07948 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNP07948 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNP07948 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNP07948 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNP07948 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNP07948 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNP07948 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNP07948 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYNP07948 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYNP07948 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYNP07948 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYNP07948 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYNP07948 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNP07948 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNP07948 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNP07948 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNP07948 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNP07948 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNP07948 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNP07948 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNP07948 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNP07948 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNP07948 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNP07948 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNP07948 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNP07948 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNP07948 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYNP07948 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYNP07948 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYNP07948 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYNP07948 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYNP07948 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYNP07948 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LYNP07948 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYNP07948 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYNP07948 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYNP07948 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYNP07948 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYNP07948 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNP07948 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNP07948 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNP07948 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNP07948 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNP07948 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNP07948 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNP07948 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNP07948 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNP07948 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNP07948 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNP07948 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNP07948 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNP07948 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNP07948 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNP07948 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNP07948 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNP07948 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LYNP07948 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYNP07948 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYNP07948 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYNP07948 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNP07948 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNP07948 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNP07948 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNP07948 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNP07948 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNP07948 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms