Protein–RNA interactions for Protein: P07900

HSP90AA1, Heat shock protein HSP 90-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA1P07900 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HSP90AA1P07900 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSP90AA1P07900 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSP90AA1P07900 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AA1P07900 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms