Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMG1P04279 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms