Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A1P02730 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A1P02730 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms