Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPRP00739 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPRP00739 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPRP00739 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPRP00739 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPRP00739 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPRP00739 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPRP00739 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPRP00739 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPRP00739 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPRP00739 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPRP00739 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPRP00739 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPRP00739 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPRP00739 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPRP00739 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPRP00739 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPRP00739 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPRP00739 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPRP00739 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPRP00739 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPRP00739 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPRP00739 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPRP00739 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPRP00739 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPRP00739 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPRP00739 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPRP00739 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPRP00739 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPRP00739 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPRP00739 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPRP00739 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPRP00739 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPRP00739 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPRP00739 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPRP00739 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPRP00739 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPRP00739 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPRP00739 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPRP00739 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPRP00739 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPRP00739 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPRP00739 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPRP00739 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HPRP00739 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HPRP00739 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPRP00739 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPRP00739 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPRP00739 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPRP00739 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPRP00739 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPRP00739 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPRP00739 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPRP00739 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPRP00739 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPRP00739 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPRP00739 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPRP00739 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPRP00739 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms