Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK1O94907 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK1O94907 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK1O94907 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK1O94907 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DKK1O94907 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DKK1O94907 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DKK1O94907 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK1O94907 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK1O94907 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK1O94907 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK1O94907 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK1O94907 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK1O94907 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK1O94907 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK1O94907 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK1O94907 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK1O94907 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK1O94907 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK1O94907 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK1O94907 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK1O94907 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK1O94907 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK1O94907 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK1O94907 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK1O94907 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK1O94907 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK1O94907 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK1O94907 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK1O94907 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK1O94907 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DKK1O94907 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK1O94907 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK1O94907 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK1O94907 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK1O94907 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK1O94907 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK1O94907 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK1O94907 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK1O94907 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK1O94907 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK1O94907 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK1O94907 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK1O94907 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK1O94907 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK1O94907 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK1O94907 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK1O94907 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK1O94907 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK1O94907 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK1O94907 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK1O94907 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK1O94907 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK1O94907 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK1O94907 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK1O94907 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK1O94907 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK1O94907 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK1O94907 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK1O94907 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK1O94907 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK1O94907 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK1O94907 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK1O94907 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK1O94907 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK1O94907 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK1O94907 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK1O94907 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK1O94907 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK1O94907 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms