Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF9O75901 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RASSF9O75901 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms