Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EIF3JO75822 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF3JO75822 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF3JO75822 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF3JO75822 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms