Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALMO75781 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALMO75781 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALMO75781 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALMO75781 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALMO75781 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALMO75781 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALMO75781 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALMO75781 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALMO75781 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALMO75781 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALMO75781 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALMO75781 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALMO75781 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALMO75781 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALMO75781 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALMO75781 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALMO75781 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALMO75781 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALMO75781 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALMO75781 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALMO75781 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALMO75781 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALMO75781 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMO75781 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMO75781 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMO75781 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMO75781 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMO75781 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMO75781 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMO75781 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PALMO75781 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMO75781 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALMO75781 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALMO75781 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALMO75781 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALMO75781 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALMO75781 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PALMO75781 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALMO75781 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALMO75781 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALMO75781 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALMO75781 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALMO75781 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALMO75781 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALMO75781 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALMO75781 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALMO75781 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALMO75781 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALMO75781 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALMO75781 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALMO75781 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALMO75781 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALMO75781 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALMO75781 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALMO75781 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALMO75781 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALMO75781 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PALMO75781 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PALMO75781 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALMO75781 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PALMO75781 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALMO75781 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALMO75781 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALMO75781 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALMO75781 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALMO75781 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALMO75781 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALMO75781 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALMO75781 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALMO75781 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALMO75781 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALMO75781 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMO75781 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMO75781 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMO75781 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMO75781 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMO75781 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMO75781 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALMO75781 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALMO75781 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALMO75781 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PALMO75781 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALMO75781 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms