Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG13O75143 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG13O75143 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG13O75143 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG13O75143 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG13O75143 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG13O75143 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG13O75143 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG13O75143 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG13O75143 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG13O75143 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG13O75143 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG13O75143 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG13O75143 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG13O75143 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG13O75143 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG13O75143 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG13O75143 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG13O75143 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG13O75143 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG13O75143 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG13O75143 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG13O75143 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG13O75143 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG13O75143 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG13O75143 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG13O75143 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG13O75143 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG13O75143 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG13O75143 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG13O75143 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG13O75143 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG13O75143 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG13O75143 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG13O75143 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG13O75143 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG13O75143 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG13O75143 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG13O75143 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG13O75143 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG13O75143 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG13O75143 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG13O75143 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATG13O75143 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG13O75143 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG13O75143 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG13O75143 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG13O75143 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG13O75143 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG13O75143 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG13O75143 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG13O75143 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG13O75143 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG13O75143 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG13O75143 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG13O75143 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG13O75143 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG13O75143 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG13O75143 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG13O75143 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG13O75143 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG13O75143 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG13O75143 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG13O75143 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG13O75143 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG13O75143 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG13O75143 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG13O75143 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG13O75143 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG13O75143 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG13O75143 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms