Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCXO43602 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCXO43602 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCXO43602 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCXO43602 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCXO43602 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCXO43602 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCXO43602 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCXO43602 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCXO43602 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DCXO43602 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCXO43602 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DCXO43602 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DCXO43602 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCXO43602 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCXO43602 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCXO43602 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCXO43602 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCXO43602 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCXO43602 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCXO43602 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCXO43602 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCXO43602 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCXO43602 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCXO43602 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCXO43602 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DCXO43602 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCXO43602 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCXO43602 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCXO43602 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCXO43602 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCXO43602 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCXO43602 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCXO43602 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCXO43602 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCXO43602 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCXO43602 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCXO43602 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCXO43602 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCXO43602 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCXO43602 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCXO43602 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCXO43602 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCXO43602 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCXO43602 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCXO43602 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCXO43602 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCXO43602 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCXO43602 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCXO43602 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCXO43602 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCXO43602 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCXO43602 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCXO43602 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCXO43602 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCXO43602 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DCXO43602 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCXO43602 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCXO43602 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCXO43602 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCXO43602 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCXO43602 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCXO43602 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCXO43602 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCXO43602 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCXO43602 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCXO43602 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCXO43602 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCXO43602 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCXO43602 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCXO43602 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCXO43602 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCXO43602 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCXO43602 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCXO43602 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DCXO43602 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCXO43602 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCXO43602 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCXO43602 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCXO43602 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCXO43602 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DCXO43602 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCXO43602 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCXO43602 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCXO43602 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms