Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT7O43581 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT7O43581 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT7O43581 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT7O43581 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT7O43581 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT7O43581 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT7O43581 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT7O43581 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT7O43581 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT7O43581 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT7O43581 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT7O43581 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT7O43581 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT7O43581 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT7O43581 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT7O43581 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT7O43581 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT7O43581 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT7O43581 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT7O43581 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT7O43581 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT7O43581 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT7O43581 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT7O43581 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT7O43581 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT7O43581 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT7O43581 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT7O43581 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT7O43581 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT7O43581 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT7O43581 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT7O43581 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT7O43581 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT7O43581 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT7O43581 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT7O43581 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT7O43581 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT7O43581 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT7O43581 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT7O43581 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT7O43581 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT7O43581 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT7O43581 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT7O43581 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT7O43581 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT7O43581 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT7O43581 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT7O43581 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT7O43581 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT7O43581 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT7O43581 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT7O43581 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT7O43581 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT7O43581 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT7O43581 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms