Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YKT6O15498 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YKT6O15498 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YKT6O15498 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YKT6O15498 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YKT6O15498 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YKT6O15498 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YKT6O15498 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YKT6O15498 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YKT6O15498 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YKT6O15498 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YKT6O15498 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YKT6O15498 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YKT6O15498 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YKT6O15498 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YKT6O15498 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YKT6O15498 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YKT6O15498 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YKT6O15498 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YKT6O15498 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YKT6O15498 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YKT6O15498 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YKT6O15498 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YKT6O15498 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YKT6O15498 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YKT6O15498 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YKT6O15498 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YKT6O15498 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YKT6O15498 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YKT6O15498 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YKT6O15498 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YKT6O15498 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YKT6O15498 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YKT6O15498 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YKT6O15498 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YKT6O15498 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YKT6O15498 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YKT6O15498 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YKT6O15498 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YKT6O15498 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
YKT6O15498 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
YKT6O15498 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
YKT6O15498 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YKT6O15498 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YKT6O15498 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YKT6O15498 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YKT6O15498 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YKT6O15498 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YKT6O15498 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YKT6O15498 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YKT6O15498 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YKT6O15498 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YKT6O15498 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YKT6O15498 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YKT6O15498 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms