Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN3O15232 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN3O15232 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN3O15232 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN3O15232 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN3O15232 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN3O15232 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN3O15232 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN3O15232 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN3O15232 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN3O15232 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN3O15232 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN3O15232 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN3O15232 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN3O15232 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN3O15232 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN3O15232 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN3O15232 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN3O15232 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN3O15232 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN3O15232 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN3O15232 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN3O15232 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN3O15232 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN3O15232 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN3O15232 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MATN3O15232 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MATN3O15232 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MATN3O15232 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MATN3O15232 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MATN3O15232 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MATN3O15232 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MATN3O15232 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MATN3O15232 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN3O15232 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN3O15232 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN3O15232 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN3O15232 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN3O15232 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN3O15232 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MATN3O15232 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MATN3O15232 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN3O15232 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MATN3O15232 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN3O15232 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN3O15232 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN3O15232 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN3O15232 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN3O15232 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN3O15232 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN3O15232 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN3O15232 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN3O15232 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN3O15232 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN3O15232 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN3O15232 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN3O15232 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN3O15232 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN3O15232 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN3O15232 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms