Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1CO15160 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1CO15160 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1CO15160 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms