Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD28O15084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD28O15084 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRD28O15084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms