Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCF2LO15068 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCF2LO15068 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms