Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F3O00716 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F3O00716 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F3O00716 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F3O00716 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F3O00716 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F3O00716 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F3O00716 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F3O00716 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F3O00716 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F3O00716 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F3O00716 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F3O00716 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F3O00716 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F3O00716 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F3O00716 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F3O00716 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F3O00716 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F3O00716 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F3O00716 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F3O00716 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F3O00716 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F3O00716 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F3O00716 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F3O00716 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F3O00716 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F3O00716 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F3O00716 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F3O00716 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F3O00716 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F3O00716 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F3O00716 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F3O00716 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F3O00716 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F3O00716 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F3O00716 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F3O00716 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F3O00716 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F3O00716 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F3O00716 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F3O00716 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F3O00716 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F3O00716 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F3O00716 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F3O00716 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F3O00716 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F3O00716 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F3O00716 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F3O00716 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F3O00716 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F3O00716 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F3O00716 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F3O00716 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F3O00716 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F3O00716 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F3O00716 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms