Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMIM22K7EJ46 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM22K7EJ46 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMIM22K7EJ46 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms