Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DEV8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DEV8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DEV8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DEV8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DEV8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DEV8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DEV8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DEV8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DEV8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DEV8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DEV8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DEV8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DEV8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DEV8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DEV8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DEV8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DEV8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DEV8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DEV8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DEV8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DEV8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DEV8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DEV8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DEV8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DEV8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DEV8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DEV8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DEV8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DEV8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DEV8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DEV8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DEV8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DEV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DEV8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DEV8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DEV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DEV8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DEV8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DEV8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DEV8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DEV8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
B4DEV8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
B4DEV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B4DEV8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B4DEV8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
B4DEV8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B4DEV8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B4DEV8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
B4DEV8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B4DEV8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B4DEV8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B4DEV8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B4DEV8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
B4DEV8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4DEV8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4DEV8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4DEV8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4DEV8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms