Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5BA8MYB1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO5BA8MYB1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO5BA8MYB1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms