Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYSRT1A8MQ03 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYSRT1A8MQ03 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms