Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB13A6NJU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB13A6NJU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NPIPB13A6NJU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB13A6NJU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB13A6NJU9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB13A6NJU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB13A6NJU9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms