Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PABPN1LA6NDY0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPN1LA6NDY0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPN1LA6NDY0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPN1LA6NDY0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms